La commission remet en cause l'efficacité et la sincérité des annonces faites en amont aux populations civiles par Tsahal avant une attaque. Selon elle, les consignes données sont souvent ''confuses, contradictoires, insuffisantes et ne laissent pas suffisamment de temps pour se mettre à l'abri''. La commission accuse aussi Israël d'avoir bombardé les couloirs humanitaires destinés à permettre aux populations de fuir.

Par ailleurs, se basant sur les images de terroristes palestiniens, menottés et en caleçon, la commission accuse Israël de crimes à caractère sexuel utilisant l'humiliation. Le rapport indique que certaines formes de violence sexuelle et sexiste font partie des schémas opérationnels des forces de sécurité israéliennes. "Cela est dû à la fréquence et à la gravité des violations, qui incluent  la nudité visant à humilier la communauté entière et à souligner l'asservissement de la population occupée", selon le rapport.

La commission s'est aussi intéressée à la Judée-Samarie et a affirmé que les forces israéliennes avaient commis des actes de violence sexuelle, de torture et des traitements inhumains ou cruels et des actes de violation de la dignité humaine. "Tout cela constitue des crimes de guerre", a affirmé la commission ajoutant que "le gouvernement d'Israël et les forces israéliennes ont autorisé, encouragé et incité une campagne de violence de la part des colons contre les communautés palestiniennes en Cisjordanie".

La commission a également évoqué les crimes du Hamas et a écrit que lors de l'attaque du 7 octobre, la branche militaire de l'organisation terroriste et six autres organisations armées se sont rendues ''responsables de crimes de guerre d'attaques intentionnelles contre des cibles civiles, de meurtres ou d'homicides volontaires, de torture, de traitements inhumains ou cruels, de destruction ou saisie des biens de l'ennemi et prise d'otages, y compris d'enfants''.

La commission a également ajouté que ''les tirs aveugles de milliers de roquettes sur des villes et villages israéliens, qui ont causé des morts et des blessés parmi les civils, constituent également une violation du droit international humanitaire et du droit international des droits de l'homme ». Selon elle, « des membres d'organisations palestiniennes armées, dans certains cas avec l'aide de Palestiniens en civil, ont délibérément tué, blessé, torturé, pris des otages, dont des enfants, et commis des violences sexuelles et sexistes contre des civils et contre des membres des forces de sécurité israéliennes, dont certains étaient hors du cercle de combat et il était interdit de leur faire du mal''.
La commission a identifié des violences sexuelles et est arrivé à la conclusion qu'il ne s'agissait pas d'incidents isolés, mais d'incidents survenus dans plusieurs endroits, principalement contre des femmes israéliennes.

En conclusion, la commission exhorte Israël à un cessez-le-feu, à mettre en oeuvre les décisions de la Cour Internationale de Justice, à augmenter l'aide humanitaire qui entre à Gaza.
Du Hamas, elle demande de cesser les tirs de roquettes sur le territoire israélien, de libérer les otages sans conditions et de juger les coupables des massacres du 7 octobre.

L'ambassade d'Israël auprès des institutions de l'ONU à Genève a déclaré en réponse que "des terroristes du Hamas ont attaqué Israël le 7 octobre pendant une fête israélienne. Aujourd’hui, jour de Chavouot, le comité d’enquête Pillai choisit de publier ses derniers rapports biaisés, attaquant Israël. Cette décision reflète la discrimination anti-israélienne systématique de cette commission d’enquête, née dans le péché en 2021, alors que le Hamas fait pleuvoir des roquettes sur les civils israéliens. La commission d'enquête tente de justifier l'attentat terroriste odieux du 7 octobre en le relatant à travers le prisme du récit palestinien", a ajouté l'ambassade. "Il ne mentionne pas des décennies de "terrorisme" ni les tirs continus de roquettes sur le territoire israélien. Les rapports ignorent l'utilisation odieuse de boucliers humains par le Hamas et la stratégie délibérée du Hamas consistant à placer des civils dans la ligne de tir. Cependant, en ce qui concerne Israël, le rapport n'a aucun problème à rejeter la responsabilité de ne pas avoir soi-disant protégé sa population le 7 octobre''.
Les autorités israéliennes rejettent le parallèle honteux fait entre les soldats de Tsahal et les terroristes du Hamas, notamment concernant les accusations infamantes de crimes sexuels.

''Israël rejette les accusations abominables et immorales portées contre Tsahal, à la fois en ce qui concerne l'opération militaire à Gaza et en ce qui concerne sa réponse initiale contre les terroristes du Hamas en Israël. Le Hamas est une organisation terroriste anarchique. Israël est un pays démocratique. L'armée israélienne se conduit conformément au droit international, y compris le droit international humanitaire, et dispose de mécanismes solides et indépendants pour surveiller et enquêter sur ses actions'', précise l'ambassade israélienne.